Kouluilla on yhteisiä johtokuntia kasvatus- ja opetustyön kehittämiseksi. Johtokunnat päättävät mm.

• koulun opetussuunnitelman
• koulun lukuvuosittain tehtävän työsuunnitelman
• koulun järjestyssäännöt

Paulaharjun koulun johtokunnassa on

• yksi opettaja johtokunnan alaisesta koulusta
• yksi muun henkilöstön jäsen johtokunnan alaisesta koulusta
• kuusi oppilaiden huoltajaa
• koulun rehtori, joka toimii esittelijänä
• ulkopuolisina kokouksissa ovat sivistysjohtaja, sivistyslautakunnan edustaja ja puheenjohtaja

Johtokunta kokoontuu muutaman kerran vuodessa.

Johtokunnan  jäsenet valitaan neljän vuoden välein. Paulaharjun koulun johtokuntaan kuuluvat: